В рамках реализации федерального проекта «Санитарный щит страны – безопасность для здоровья (предупреждение, выявление, реагирование)» с 2021 года на территории Российской Федерации созданы 36 ПЦР-центров и 54 центра секвенирования, в том числе на базе лабораторий отдела микробиологических исследований ФБУЗ «ЦГиЭ в Оренбургской области». В 2021-2022 гг приобретено и введено в эксплуатацию   необходимое оборудование).

Специалисты лаборатории молекулярно-генетических исследований в 2022 году прошли обучение по фрагментарному и полногеномноому секвенированию SARS-CoV-2 на базах ФКУН Российский Противочумный Институт «Микроб» Роспотребнадзора, г. Саратов, ФБУН «Научно-исследовательский институт системной биологии и медицины» Роспотребнадзора, г.Москва. Во время обучения был получен уникальный опыт работы на оборудовании нового поколения, появилась возможность проводить подобные исследования на базе Центра.

С января 2023 года и по настоящее время Центр секвенирования проводит полногеномное секвенирование SARS-CoV-2.  Технология позволяет делать прямое прочтение цепей ДНК или РНК в режиме онлайн и определять геновариант SARS-CoV-2 для каждого загруженного образца.

За 2023 – 2024 гг обработано порядка 2 тысяч образцов. По результатам исследований определено, что на территории области преобладал штамм Омикрон.

В перспективе – секвенирование генома возбудителей гриппа, ОРВИ, ВИЧ-инфекции, вирусных гепатитов и др. Центр продолжает совершенствовать работу, внедрять современные технологии исследований для достижения главной цели проекта – обеспечить проведение современной молекулярно-генетической диагностики инфекционных заболеваний.